研究方面，各實驗室自由選擇生命科學內重要的課題，以適當的技術及方法來研究，並期成果達國際一流水準，能對全人類之科技發展及健康有所貢獻，並特別重視國人易罹患但較被國際忽視的疾病，希望能自行研發預防及治療方法。為達成以上目標，各實驗室均積極爭取經費、合作交流，提昇研究水準。微免所在教育方面之特色：

一. 重視個別發展 僅規劃少數必修課程，其餘課程依學生興趣，由指導教授協助選修。

二. 採進階式課程 各領域規劃一系列由淺入深，先博後專之課程，循次漸進。

三. 強調精緻教育 以小班制的教學，提供師生自由討論之機會，促進懷疑及思考能力。

四. 著重實際操作 及早決定研究題目，訓練獨立研究之能力。

微生物學科之教學目標，主要是奠立醫學系、牙醫學系、醫技系及護理系學生在微生物學、病毒學及免疫學方面之基礎知識，使其能應用於臨床醫學、微生物診斷學及基礎醫學之研究。 微免所之教學目標則在培育第一流的研究及教學人才。特別著重學生能對生命科學有整體性之認識及了解，明瞭世界之重大研究趨勢，具純熟技術、分析及推理能力，可組織人力物力時間，能創造設計實驗，可獨立完成高品質研究工作，並具良好之書寫及語言溝通能力。